会计档案的整理与编号必须遵循一定的规则，否则难以有序进行。准确的标题应为会计档案整理方法。首先需制定管理规则，再根据规则进行分类，最后实施编号。具体规则的制定还需结合单位规模、档案数量等实际情况，确保分类合理、编号清晰，便于后续查找与管理，提升档案工作的规范性与效率。
1、 会计档案编号格式详见附图。
2、 根据科学与档案管理实践，会计档案编号应遵循以下格式：
3、 全宗号、目录号与案卷号的组合编码
4、 全宗号通常由档案局统一制定，所属单位可向档案局查询获取。
5、 企业尤其是民营企业由单位自行确定，规模较小者可不设全宗号。
6、 目录编号样式
7、 会计档案通常分为凭证、账簿、财务报告及其他四类，结合年度信息，其目录编号按特定格式编制。
8、 大类码、小类码、年份与序号组合编码
9、 会计凭证J1。
10、 收款凭证为J1.1，付款凭证为J1.2，转账凭证为J1.3，其他类别依次类推。
11、 会计账簿 J2
12、 账簿通常按年度分类，并按前述方法进行编号。
13、 财务报告J3
14、 财务报告按年度分类后，可参照前述方法编号。
15、 其他J4
16、 清册保管与销毁编号为J4.1，移交清册为J4.2，调节表及对账单为J4.3，工资表单独列为J4.4，其余依此类推进行分类编号。
17、 例如2015年1月工资表，编号为QY-J4.4-2007-1。
18、 案卷号格式
19、 案卷编号从1至999按自然顺序排列。
20、 案卷封面样式
21、 按年度和保管期限，在同一类别会计档案中依次排序存放。
22、 案卷背脊样式
23、 全宗号是档案馆为归档单位设定的编号，视具体情况而定，并非所有单位都需要。
24、 目录号：即目录的编号。
25、 案卷号为卷内唯一顺序编号，不得重复。
26、 案卷目录样式
27、 按会计档案顺序编制卷内目录。
