合伙型基金权益分配与清算按协议约定执行，通常先返还本金后分收益。
1、 合伙型股权投资基金的利润分配与亏损分担，首先依照合伙协议约定执行；若协议未作约定或约定不明，则由合伙人协商确定；协商无法达成一致的，按各合伙人实际缴纳的出资比例进行分配与分担；当出资比例难以确定时，由全体合伙人平均分配和分担相关权益与责任。
2、 第二，合伙型股权投资基金解散时，应由清算人负责清算工作。清算期间，基金继续存续，但不得从事与清算无关的经营活动。基金财产在优先支付清算费用、职工工资、社保费用、法定补偿金、欠缴税款及清偿债务后，将剩余资产按约定向各合伙人进行分配。
3、 第三，设立合伙型股权投资基金需依法向工商管理部门办理注册登记，并向中国证券投资基金协会履行备案程序；涉及基金的增资、减资、合伙人变更或终止清算等事项，亦应按规定向工商管理部门办理相应的变更或注销登记手续。
