少女前线云图计划与原版在玩法、剧情及系统上有所不同，两者各有特色，具体内容可通过对比介绍了解。
1、 剧情各异
2、 少女前线：云图计划的剧情设定在少女前线主线故事之前，属于前传性质，讲述了更早时期的相关事件与发展。
3、 玩法各异
4、 少女前线：云图计划是款融合Roguelike元素的二次元3D战棋射击手游，相较前作的2D画面，本作在视觉表现与玩法上均有显著升级与创新。
5、 建设功能：
6、 少女前线原本无建造系统，而少女前线：云图计划新增了建设玩法。玩家可在探险中收集材料，自由建造城市、升级设施、装饰宿舍，打造个性化基地。
