此前主要介绍ChemDraw的应用,而ChemOffice功能远不止于此。接下来将探讨其更高级的功能,以预测巴豆醛过渡态能量为例进行说明,展示软件在化学计算与分析中的深层应用,帮助用户更全面地掌握其强大特性。
1、 用Chem3D画出巴豆醛分子结构
2、 进行最低能量计算。
3、 在菜单栏中依次选择Calculation下的MM2,点击Minimize Energy,系统将弹出相应的参数设置对话框,等待用户进行后续操作。
4、 从Job下拉菜单选择Minimize Energy,点击Run开始计算。
5、 计算结果已在输出窗口中显示。
6、 计算结果显示,巴豆醛的总能量值为4.6330千卡每摩尔。
7、 总能量受空间结构影响,因人而异,计算结果通常不同。
8、 改进过渡态计算方法
9、 在菜单栏中依次点击Calculation、GAMESS Interface,然后选择Optimize to Translation State,此时将弹出GAMESS Interface设置对话框,供后续参数配置与操作使用。
10、 在Job下拉菜单中选择Optimize to Translation State,然后点击Run开始计算。该过程耗时较长,需耐心等待,请提前做好准备。
11、 计算结果已在输出窗口中显示。
