基因新手如何入门?让我们逐步探索,争取每周更新一篇相关文章。
1、 拿到一个物种的相关基因进行分析时,
2、 假设基因名称为Potri.012G087100,其功能可能与植物生长发育相关。
3、 首先,在Phytozome查找基因信息。通常,普通DNA的PCR使用
4、 设计引物时,可用基因组序列或RNA反转录的cDNA编码序列(CDS)作为依据。

5、 如果你研究的物种未测序,仅有近缘种参考基因组,建议多设计几对引物,避免因物种间存在SNP或Indel差异导致扩增失败。
6、 片段扩增的具体选择通常由后续实验需求决定,例如基因过表达或基因敲除。如果是基因敲除,为确保纯合位点的准确性,一般会针对靶位点前后序列进行PCR扩增,并将产物连接至P-easy blunt载体后测序。获得测序结果后,可利用DNAMAN、Bioxm等软件对序列进行比对分析。此外,Snapgene可用于绘制载体图谱,方便实验设计与验证。
7、 对了,有个网站叫Addgene,基本上这个网站上都能找到载体序列。
