在口袋妖怪：漆黑的魅影5.0开局时，玩家需从御三家宝可梦中选择一只。其中水系御三家可通过初始选择直接获得，具体为杰尼龟或其进化形态。
1、 开局可从水、火、草三系初始宝可梦中选择，推荐选用水系的水水獭。
2、 在宝可梦：漆黑的魅影5.0中，历代御三家宝可梦基本均可捕捉。
3、 101号道路可捕捉草系宝可梦，如藤藤蛇、妙蛙种子、木守宫和菊草叶等。
4、 古辰镇上方的103号道路是水系御三家宝可梦的栖息地，可在此邂逅杰尼龟、水跃鱼、小锯鳄及水水獭等。
5、 古辰镇左侧的102号道路是火系御三家宝可梦的栖息地，常见小火龙、火稚鸡、暖暖猪和火球鼠等。
6、 历代御三家宝可梦实力均衡，种族值总和普遍约525，培养一两只便足以通关主线剧情。
